二○○八年後，
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，政府與遠通長達六年的角力過程，
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，是一場漫長且艱巨的拉鋸戰。
二○○二年時，
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，立法院交通委員會將高公局編列有關ＥＴＣ委託建置預算，
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，刪到只剩一元，
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，在立委壓力下，
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，當時的交通部長林陵三決定，
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，ＥＴＣ改採ＢＯＴ，交由民間興建，遠通電收在激烈競爭下，取得最優申請人資格。
不過，第一條ＥＴＣ車道在二○○六年一上路，就引來爭議。關鍵在，計程收費政策成敗與車上機（ＯＢＵ）申裝率高低息息相關；但當時遠通提供須付費的ＯＢＵ，每個要價高達一千一百九十九元，申裝率始終低迷。
二○○八年，政黨輪替後，時任交通部長的行政院副院長毛治國面臨的兩大難題─高鐵與國道計程，雖然國道計程ＢＯＴ花費遠不如高鐵，卻牽連最廣、最棘手。毛治國上任後，發現ＥＴＣ利用率都只有三成多，決定和遠通談判，要求遠通要提供免費的車上機。
但麻煩的是，合約中沒有規定ＯＢＵ不能收費。毛治國一邊向遠通道德勸說，希望他們可以說服內部股東，讓ＯＢＵ降價，甚至免費；另一方面也祭出合約的「棒子」，設下每一階段使用率需達多少比率的「檢核點」，否則可按日開罰。
在雙方長達一年多的談判，毛治國終於成功說服遠通，將原本採用紅外線系統改成RFID（無線射頻），就可透過成本較低的eTag接收訊號。前年五月起，遠通電收提供用路人免費申裝eTag，並要求遠通全價收購當時賣出的ＯＢＵ，利用率果然很快提升，在計程上路前，已逼近九成。
當時遠通僵局難解，交通部一度思考「解約」一途，甚至也打算由第二家接手。雖然國道計程不像高鐵「大到不能倒」，但交通部評估，若「合意解約」，政府至少得再花超過五十億「價購」，立法院恐難接受；更重要的是，如果由新廠商接手，至少要三年的建置期，這段空窗期，恐怕更是國家難以承受。最後仍決定由遠通繼續經營，並設法化解爭議難題，繼續往下走。，