兩岸航線特殊，
主機代管
，無法比照國際慣例讓民航主管機關透過授權至對方飛機維修廠做檢查，
漸進式排名
，以致於飛機若發生問題，
網路行銷
，須回航空器登記地檢修，
網路代銷
，浪費人力時間，
網站租用
，進而增加飛安風險。
該協議盼建立兩岸適航驗證標準，雙方認證後的維修廠能就近相互檢修航空器及使用認證零組件。
兩岸每周直航班機828班，是2008年7月每周36班周末包機的23倍。大陸方面曾建議台北市航空運輸商業同業公會，與大陸兩岸航空運輸交流委員會為彼此適航驗證的發證單位，但迄今未有下文。，